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三个远交系豚鼠微卫星遗传结构分析

2018年12月06日 浏览量: 评论(0) 来源:中国比较医学杂志2018年第11期 作者:刘迪文 谭海明 陈雁虹 卫振 责任编辑:admin
摘要:评估我校培育的三个远交系豚鼠种群的微卫星遗传结构,筛选不同种群间呈现差异等位基 因的微卫星位点,为今后豚鼠遗传育种及应用提供资料。

目的:评估我校培育的三个远交系豚鼠种群的微卫星遗传结构,筛选不同种群间呈现差异等位基 因的微卫星位点,为今后豚鼠遗传育种及应用提供资料。

方法:使用45对引物通过PCR及电泳技术,对我校三个 豚鼠种群的微卫星DNA进行扩增分析,计算各位点等位基因多态性等参数,并筛选出种群间等位基因呈差异变化 的微卫星位点。

结果:所有微卫星位点在豚鼠种群中呈多态性变化,各位点等位基因数2 ~ 7不等,平均位点基 因数2.29,平均有效基因数1.74;平均期望杂合度为0.39,平均观测杂合度为0.2 多态信息含量的可信范围为 0.0739 ~ 0.6443,平均PIC为0.3 68.9%的位点呈中度多态性;总Hardy-Weinberg平衡 P 值平均为0.1734,各种 群均为 P> 0.05,但对每个位点的基因平衡状态来讲,共有20个位点极显著偏离Hardy-Weinberg平衡,种群平均 偏离指数D为-0.407;平均分化指数Fst为0.136,平均基因流Nm为5.835,还阐明了种群间的Nei遗传距离及遗 传相似度。

结论:三个豚鼠种群遗传呈中度多态性变化,种群间平均遗传差异无显著性,遗传相似度较高。 群体 遗传偏离Hardy-Weinberg平衡较突出,出现严重的近交现象,群体处于中等遗传变异水平,但较高的基因流动阻止 了遗传分化发生。 分析这些问题的原因,主要是本群体繁殖数量偏小,种子选择范围不广泛等,今后在培育过程中 要引起重视。 本课题还筛选到与不同种群或毛色豚鼠相关的微卫星位点12个,种群特征性微卫星位点7个,可能 用于性状基因定位。 

全文阅读: 三个远交系豚鼠微卫星遗传结构分析 

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